Publications

2024
Research Articles
  1. Minoji, K., and Sakai, T. (2024). A chromosome-scale genome assembly of Timorese crabgrass (Digitaria radicosa): a useful genomic resource for the Poaceae. Biorxiv
  2. Chia, K.S., Kourelis, J., Teulet, A., Vickers, M., Sakai, T., Walker, J.F., Schornack, S., Kamoun, S., and Carella, P. (2024). The N-terminal domains of NLR immune receptors exhibit structural and functional similarities across divergent plant lineages. The Plant cell, 10:koae113.
  3. Oikawa, K., Fujisaki, K., Shimizu, M., Takeda, T., Nemoto, K., Saitoh, H., Hirabuchi, A., Hiraka, Y., Bialas, A., Langner, T., Kellner, R., Bozkurt, T.O., Cesari, S., Kroj, T., Banfield, M.J., Kamoun, S., and Terauchi, R. (2024). The blast pathogen effector AVR-Pik binds and stabilizes rice heavy metal-associated (HMA) proteins to co-opt their function in immunity. Biorxiv
  4. Zdrzalek, R., Xi, Y., Langner, T., Bentham, A.R., De la Concepcion, J.C., Harant, A., Shimizu, M., Were, V., Talbot, N.J., Terauchi, R., Kamoun, S., and Banfield, M.J. (2024). Bioengineering a plant NLR immune receptor with a robust binding interface towards a conserved fungal pathogen effector. Biorxiv
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 美濃地弘樹*, 堺俊之, 太田敦士, 杉原優, 寺内良平. 交雑起源の検証に向けたアラインメントフリーな新手法の開発 (口頭発表). 日本育種学会 第145回講演会(令和5年度春季大会), 2024年3月
  2. 太田敦士*, 新田みゆき, 那須田周平, 吉田健太郎, 堺俊之, 竹中祥太朗, 松岡由浩, 森直樹, 西嶋遼, 寺内良平. NBRP・コムギ事業:大規模交配集団の整備 (ポスター). 日本育種学会 第145回講演会(令和5年度春季大会), 2024年3月
2023
Research Articles
  1. Sakai, T., Martinez-Anaya, C., Contreras, M, P., Kamoun, S., Wu, C., Adachi, H. (2023). The NRC0 gene cluster of sensor and helper NLR immune receptors is functionally conserved across asterid plants. Biorxiv, 2023.10.23.563533
  2. Adachi, H., Sakai, T., Kourelis, J., Pai, H., Gonzalez Hernandez, J. L., Utsumi, Y., Seki, M., Maqbool, A., & Kamoun, S. (2023). Jurassic NLR: Conserved and dynamic evolutionary features of the atypically ancient immune receptor ZAR1. The Plant cell, 35(10), 3662–3685. https://doi.org/10.1093/plcell/koad175
  3. Sakai, T., Fujioka, T., Uemura, T., Saito, S., Terauchi, R., Abe, A. (2023). Whole-genome analysis of recombinant inbred rice lines reveals a quantitative trait locus on chromosome 3 with genotype-by-environment interaction effects. G3 Genes|Genomes|Genetics, 2023;, jkad082, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkad082
  4. Sugihara, Y., Abe, Y., Takagi, H., Abe, A., Shimizu, M., Ito, K., Kanzaki, E., Oikawa, K., Kourelis, J., Langner, T., Win, J., Białas, A., Lüdke, D., Contreras, M. P., Chuma, I., Saitoh, H., Kobayashi, M., Zheng, S., Tosa, Y., Banfield, M., Kamoun, S., Terauchi, R., & Fujisaki, K. (2023). Disentangling the complex gene interaction networks between rice and the blast fungus identifies a new pathogen effector. PLOS Biology, 21(1), e3001945-. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001945
  5. Adachi, H., Sakai, T., Harant, A., Pai, H., Honda, K., Toghani, A., Claeys, J., Duggan, C., Bozkurt, T. O., Wu, C., & Kamoun, S. (2023). An atypical NLR protein modulates the NRC immune receptor network in Nicotiana benthamiana. PLOS Genetics, 19(1), e1010500-. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010500
  6. Kovi, B., Sakai, T., Abe, A., Kanzaki, E., Terauchi, R., & Shimizu, M. (2023). Isolation of Pikps, an allele of Pik, from the aus rice cultivar Shoni. Genes & Genetic Systems, advpub. https://doi.org/10.1266/ggs.22-00002
Reviews
  1. Yoshioka, H., Hino, Y., Iwata, K., Ogawa, T., Yoshioka, M., Ishihama, N., & Adachi, H. (2023). Dynamics of plant immune MAPK activity and ROS signaling in response to invaders. Physiological and Molecular Plant Pathology, 125, 102000. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2023.102000
International Presentations

* Presenter

  1. Ryohei Terauchi*. Kihara’s Legacy: Wheat genetic resource in Kyoto University (NBRP Wheat) -its current status and potential for enhancing world wheat production., New developments in wheat research: Genetic resources and genomics reflecting a century of research history (Kyoto University, Faculty of Agriculture 100th Anniversary Project). Invited talk
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 林航大*, 寺内良平, 太田敦士. チモフェービ系コムギとその祖先種における種子の形状と重量の比較解析 (ポスター). 第18回ムギ類研究会, 2023年12月
  2. 太田敦士*, 新田みゆき, 那須田周平, 吉田健太郎, 堺俊之, 竹中祥太朗, 松岡由浩, 森直樹, 西嶋遼, 寺内良平. NBRP・コムギ事業:大規模交配集団の整備 (ポスター). 第18回ムギ類研究会, 2023年12月
  3. 美濃地弘樹*, 太田敦士, 杉原優, 工藤葵, 堺俊之, 寺内良平. 高次倍数性ヤマノイモ類の系統解析 (ポスター). 学術変革領域「挑戦的両性花原理」若手の会, 2023年10月 *ポスター賞
  4. 工藤葵*, 杉原優, 阿部陽, 及川香梨, 夏目俊, 清水元樹, 伊藤和江, 辻村真衣, 寺地徹, 太田敦士, 寺内良平. 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定 (口頭発表). 学術変革領域「挑戦的両性花原理」若手の会, 2023年10月 *口頭発表賞
  5. 寺内良平*. イネ-いもち病菌分子間相互作用の解析. 日本育種学会 第144回講演会(令和5年度秋季大会). 神戸大学. 2023年9月. *招待講演
  6. 安達広明*. 耐病性育種に向けたNLR免疫受容体ネットワークの包括的な理解. 日本育種学会 第144回講演会(令和5年度秋季大会). 神戸大学. 2023年9月. *招待講演
  7. 美濃地弘樹*, 太田敦士, 杉原優, 工藤葵, 堺俊之, 寺内良平. ゲノムワイドSNPsを用いた日本産食用ヤマノイモ類の系統解析 (口頭発表). 日本育種学会第144回講演会, 神戸大学, 2023年9月
  8. 工藤葵*, 杉原優, 阿部陽, 及川香梨, 夏目俊, 清水元樹, 伊藤和江, 辻村真衣, 寺地徹, 太田敦士, 寺内良平. 雌雄異株植物オニドコロにおける性決定候補遺伝子の同定 (口頭発表). 日本育種学会第144回講演会, 神戸大学, 2023年9月 ※日本育種学会優秀発表賞
  9. 太田敦士, 新田みゆき, 齋藤歩, 平澤美保子, 松岡由浩, 川浦香奈子, 大田正次, 石川裕子, 吉田健太郎, 那須田周平, 寺内良平. 田中正武アーカイブズ整備とコムギリソースへの紐付け (ポスター). 日本育種学会第144回講演会, 神戸大学, 2023年9月
  10. 工藤葵*. 形態が異なるが種分類指標遺伝子には差異がないトコロミコガ2系統における全ゲノム解析 (口頭発表). 第82回レピゼミ, 京都府立大学, 2023年4月
  11. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 堺俊之, 寺内良平. 雌雄異株植物オニドコロにおける青色光応答で上を向くオス花序の送粉効率 (ポスター). 第70回日本生態学会大会, オンライン, 2023年3月
  12. 本田晃大*・大津美奈・寺内良平・安達広明.ベンサミアナタバコにおける免疫受容体ネットワークの制御因子の細胞内局在解析(口頭発表). 令和5年度日本植物病理学会関西部会.近畿大学.2023年9月.
  13. 安達広明*, 堺俊之, Jiorgos Kourelis, Hsuan Pai, Jose L. Gonzalez Hernandez, 内海好規, 関原明, Abbas Maqbool, Sophien Kamoun.種子植物に保存された免疫受容体ZAR1遺伝子の進化学的解析(口頭発表).令和5年度日本植物病理学会関西部会.近畿大学.2023年9月.
  14. 林 優介*, 吉岡美樹, 日野雄太, 安達広明, 高野義孝, 別役重之, 鳴坂真理, 鳴坂義弘, 吉岡博文.半活物寄生菌や殺生菌を接種したベンサミアナタバコにおけるSA・JAシグナルの時空間的な活性動態(口頭発表).令和5年度日本植物病理学会関西部会.近畿大学.2023年9月.
  15. 本田晃大*・大津美奈・寺内良平・安達広明. ベンサミアナタバコの免疫受容体ネットワークを構成するNLRタンパク質の細胞内局在解析(ポスター). 第57回日本植物病理学会 植物感染生理談話会.岡山大学.2023年9月.*優秀発表賞
  16. 吉岡博文*, 日野雄太, 岡本渓太, 稲田太一, 小川尊也, 安達広明, 吉岡美樹.活性酸素シグナルによる植物免疫応答の分子機構(口頭発表).第57回日本植物病理学会 植物感染生理談話会.岡山大学.2023年9月.
  17. 筒泉宏樹*, 太田敦士, 寺内良平. コムギ近縁野生種 Aegilops caudata における芒抑制遺伝子座の同定 (口頭発表). 日本育種学会第143回講演会, 静岡大学, 2023年3月
  18. 太田敦士*, 西原萌笑, 寺内良平. コムギ近縁野生種Aegilops bicornis の穂形態変異に関わる遺伝子座の同定 (口頭発表). 日本育種学会第143回講演会, 静岡大学, 2023年3月
2022
Research Articles
  1. Chia, K.-S., Kourelis, J., Vickers, M., Sakai, T., Kamoun, S., & Carella, P. (2022). The N-terminal executioner domains of NLR immune receptors are functionally conserved across major plant lineages. BioRxiv, 2022.10.19.512840. https://doi.org/10.1101/2022.10.19.512840
  2. Kourelis, J., Contreras, M. P., Harant, A., Pai, H., Lüdke, D., Adachi, H., Derevnina, L., Wu, C.-H., & Kamoun, S. (2022). The helper NLR immune protein NRC3 mediates the hypersensitive cell death caused by the cell-surface receptor Cf-4. PLOS Genetics, 18(9), e1010414-. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010414
  3. de la Concepcion, J. C., Fujisaki, K., Bentham, A. R., Cruz Mireles, N., Sanchez de Medina Hernandez, V., Shimizu, M., Lawson, D. M., Kamoun, S., Terauchi, R., & Banfield, M. J. (2022). A blast fungus zinc-finger fold effector binds to a hydrophobic pocket in host Exo70 proteins to modulate immune recognition in rice. Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(43), e2210559119. https://doi.org/10.1073/pnas.2210559119
  4. Takeda, T., Takahashi, M., Shimizu, M., Sugihara, Y., Yamashita, T., Saitoh, H., Fujisaki, K., Ishikawa, K., Utsushi, H., Kanzaki, E., Sakamoto, Y., Abe, A., & Terauchi, R. (2022). Rice apoplastic CBM1-interacting protein counters blast pathogen invasion by binding conserved carbohydrate binding module 1 motif of fungal proteins. PLOS Pathogens, 18(9), e1010792-. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1010792
  5. Lin, X., Olave-Achury, A., Heal, R., Pais, M., Witek, K., Ahn, H.-K., Zhao, H., Bhanvadia, S., Karki, H. S., Song, T., Wu, C., Adachi, H., Kamoun, S., Vleeshouwers, V. G. A. A., & Jones, J. D. G. (2022). A potato late blight resistance gene protects against multiple Phytophthora species by recognizing a broadly conserved RXLR-WY effector. Molecular Plant. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.molp.2022.07.012
  6. Natsume, S., Sugihara, Y., Kudoh, A., Oikawa, K., Shimizu, M., Ishikawa, Y., Nishihara, M., Abe, A., Innan, H., & Terauchi, R. (2022). Genome Analysis Revives a Forgotten Hybrid Crop Edo-dokoro in the Genus Dioscorea. Plant and Cell Physiology, pcac109. https://doi.org/10.1093/pcp/pcac109
  7. Sugihara, Y., Abe, Y., Takagi, H., Abe, A., Shimizu, M., Ito, K., Kanzaki, E., Oikawa, K., Kourelis, J., Langner, T., Win, J., Białas, A., Lüdke, D., Chuma, I., Saitoh, H., Kobayashi, M., Zheng, S., Tosa, Y., Banfield, M. J., Kamoun, S., Terauchi, R., Fujisaki, K. (2022). Tangled gene-for-gene interactions mediate co-evolution of the rice NLR immune receptor Pik and blast fungus effector proteins. BioRxiv, 2022.07.19.500555. https://doi.org/10.1101/2022.07.19.500555
  8. Shimizu, M., Hirabuchi, A., Sugihara, Y., Abe, A., Takeda, T., Kobayashi, M., Hiraka, Y., Kanzaki, E., Oikawa, K., Saitoh, H., Thorsten, L., J, B. M., Kamoun, S. & Terauchi, R. (2022). A genetically linked pair of NLR immune receptors shows contrasting patterns of evolution. Proceedings of the National Academy of Sciences, 119(27), e2116896119. https://doi.org/10.1073/pnas.2116896119 京大プレスリリース
  9. de la Concepcion, J. C., Fujisaki, K., Bentham, A. R., Cruz Mireles, N., Sanchez de Medina Hernandez, V., Shimizu, M., Lawson, D. M., Kamoun, S., Terauchi, R., & Banfield, M. J. (2022). Binding of a blast fungus Zinc-finger fold effector to a hydrophobic pocket in the host exocyst subunit Exo70 modulates immune recognition in rice. BioRxiv, 2022.06.18.496527. https://doi.org/10.1101/2022.06.18.496527
  10. Maidment, J. H. R., Shimizu, M., Vera, S., Franceschetti, M., Longya, A., Stevenson, C. E. M., de la Concepcion, J. C., Bialas, A., Kamoun, S., Terauchi, R., & Banfield, M. J. (2022). Effector target-guided engineering of an integrated domain expands the disease resistance profile of a rice NLR immune receptor. BioRxiv, 2022.06.14.496076. https://doi.org/10.1101/2022.06.14.496076
  11. Natsume, S., Yaegashi, H., Sugihara, Y., Abe, A., Shimizu, M., Oikawa, K., White, B., Kudoh, A., & Terauchi, R. (2022). Whole genome sequencing of a wild yam species Dioscorea tokoro reveals a genomic region associated with sex. BioRxiv, 2022.06.11.495741. https://doi.org/10.1101/2022.06.11.495741
  12. Kato, H., Nemoto, K., Shimizu, M., Abe, A., Asai, S., Ishihama, N., Matsuoka, S., Daimon, T., Ojika, M., Kawakita, K., Onai, K., Shirasu, K., Yoshida, M., Ishiura, M., Takemoto, D., Takano, Y., & Terauchi, R. (2022). Recognition of pathogen-derived sphingolipids in Arabidopsis. Science, 376(6595), 857–860. https://doi.org/10.1126/science.abn0650
  13. Kobayashi, M., Utsushi, H., Fujisaki, K., Takeda, T., Yamashita, T., & Terauchi, R. (2022). A jacalin-like lectin domain-containing protein of Sclerospora graminicola acts as an apoplastic virulence effector in plant–oomycete interactions. Molecular Plant Pathology, n/a(n/a). https://doi.org/https://doi.org/10.1111/mpp.13197
  14. Moghaddam, M., Ohta, A., Shimizu, M., Terauchi, R., & Kazempour-Osaloo, S. (2022). The complete chloroplast genome of Onobrychis gaubae (Fabaceae-Papilionoideae): comparative analysis with related IR-lacking clade species. BMC Plant Biology, 22(1), 75. https://doi.org/10.1186/s12870-022-03465-4
  15. Takeda, T., Takahashi, M., Shimizu, M., Sugihara, Y., Saitoh, H., Fujisaki, K., Ishikawa, K., Utsushi, H., Kanzaki, E., Sakamoto, Y., Abe, A., & Terauchi, R. (2022). Apoplastic CBM1-interacting proteins bind conserved carbohydrate binding module 1 motifs in fungal hydrolases to counter pathogen invasion. BioRxiv, 2021.12.31.474618. https://doi.org/10.1101/2021.12.31.474618
Reviews
  1. Kourelis, J., & Adachi, H. (2022). Activation and Regulation of NLR Immune Receptor Networks. Plant and Cell Physiology, pcac116. https://doi.org/10.1093/pcp/pcac116
  2. Adachi, H., & Kamoun, S. (2022). NLR receptor networks in plants. Essays in Biochemistry, EBC20210075. https://doi.org/10.1042/EBC20210075
Presentations at International Symposium

* Presenter

  1. Ryohei Terauchi*. Molecular interactions between rice NLRs and Magnaporthe effectors. 12th Japan-US Seminar in Plant Pathology. Cornell University, US, August, 2022 ※Keynote lecture
  2. Hiroaki Adachi*. An atypical NLR modulates the NLR network in Nicotiana benthamiana (Oral presentation). 12th Japan-US Seminar in Plant Pathology. Cornell University, US, August, 2022
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 上向きのオスと下向きのメス:雌雄異株植物オニドコロのオス花序は青色光に応答する (ポスター). 挑戦的両性花原理領域 若手の会, 2022年10月 ポスター賞およびAI賞(ダブル受賞)
  2. 太田敦士*. Aegilops Sitopsis節二倍体野生種における芒関連遺伝子マッピング (口頭発表). 麦学セミナー, オンライン, 2022年10月
  3. 堺俊之, 寺内良平, 阿部陽. イネNAM集団を用いたGenomic Predictionモデルの構築および育種への応用 (口頭発表). 日本育種学会第142回講演会, 帯広畜産大学、2022年9月 日本育種学会優秀発表賞
  4. 工藤葵, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. Upright male and pendente female: effects of pollinators and seed eater in inflorescence angle of Dioscorea tokoro (口頭発表). 第69回日本生態学会, オンライン, 2022年3月
  5. 工藤葵, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 上向きのオスと下向きのメス:雌雄異株植物オニドコロの花序角度と送粉効率・種子被食率の関係 (ポスター). 日本植物分類学会第21回大会, オンライン, 2022年3月
  6. 細井早菜子*, 富田淳, 村川未果, 前田麻友子, 山根京子, 太田敦士. コムギ, エギロプス属エマルジナータ亜節4種における側芒抑制候補遺伝子C2H2-ZFの塩基配列多型および発現解析 (口頭発表). 日本育種学会第141回講演会, オンライン, 2022年3月
2021
Research Articles
  1. Kourelis J, Sakai T, Adachi H, Kamoun S (2021) RefPlantNLR is a comprehensive collection of experimentally validated plant disease resistance proteins from the NLR family. PLoS Biol 19(10): e3001124.
  2. Kato, H., Nemoto, K., Shimizu, M., Abe, A., Asai, S., Ishihama, N., Daimon, T., Ojika, M., Kawakita, K., Onai, K., Shirasu, K., Ishiura, M., Takemoto, D., Takano, Y. and Terauchi, R. (2021). Pathogen-derived 9-methyl sphingoid base is perceived by a lectin receptor kinase in Arabidopsis. BioRxiv, 2021.10.18.464766. https://doi.org/10.1101/2021.10.18.464766
  3. Monjil, M. S., Kato, H., Matsuda, K., Suzuki, N., Tenhiro, S., Camagna, M., Suzuki, T., Tanaka, A., Terauchi, R., Sato, I., Chiba, S., Kawakita, K., Ojika, M. and Takemoto, D. (2021). Two structurally different oomycete MAMPs induce distinctive plant immune responses. BioRxiv, 2021.10.22.465218. https://doi.org/10.1101/2021.10.22.465218
  4. Adeline Harant, Hsuan Pai, Toshiyuki Sakai, Sophien Kamoun, Hiroaki Adachi. (2021) A vector system for fast-forward studies of the HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE1 (ZAR1) resistosome in the model plant Nicotiana benthamiana. Plant Physiology, kiab471
  5. Białas, A., Langner, T., Harant, A., Contreras, M. P., Stevenson, C. E. M., Lawson, D. M., …, Terauchi, R., Banfield, M. J. & Kamoun, S. (2021). Two NLR immune receptors acquired high-affinity binding to a fungal effector through convergent evolution of their integrated domain. ELife, 10, e66961. https://doi.org/10.7554/eLife.66961
  6. Shimizu, M., Hirabuchi, A., Sugihara, Y., Abe, A., Takeda, T., Kobayashi, M., … Terauchi, R. (2021). A genetically linked pair of NLR immune receptors show contrasting patterns of evolution. BioRxiv, 2021.09.01.458560. https://doi.org/10.1101/2021.09.01.458560
  7. Pingtao Ding, Toshiyuki Sakai, Ram Krishna Shrestha, Nicolas Manosalva Perez, Wenbin Guo, Bruno Pok Man Ngou, Shengbo He, Chang Liu, Xiaoqi Feng, Runxuan Zhang, Klaas Vandepoele, Dan MacLean, Jonathan D G Jones. (2021) Chromatin accessibility landscapes activated by cell-surface and intracellular immune receptors. Journal of Experimental Botany, erab373
  8. Toshiyuki Sakai, Abe, A., Shimizu, M., Terauchi, R. (2021). RIL-StEp: epistasis analysis of rice recombinant inbred lines (RILs) reveals candidate interacting genes that control seed hull color and leaf chlorophyll content. G3 Genes|Genomes|Genetics, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab130
  9. De la Concepcion, J. C., Benjumea, J. V., Białas, A., Terauchi, R., Kamoun, S., & Banfield, M. J. (2021). Functional diversification gave rise to allelic specialization in a rice NLR immune receptor pair. eLife, 2021;10:e71662. https://doi.org/10.7554/eLife.71662
  10. Bentham, A. R., Petit-Houdenot, Y., Win, J., Chuma, I., Terauchi, R., Banfield, M. J., … Langner, T. (2021). A single amino acid polymorphism in a conserved effector of the multihost blast fungus pathogen expands host-target binding spectrum. PLOS Pathogens 17(11): e1009957. https://doi.org/10.1101/2021.03.15.435478
  11. Mutoh, R., Iwata, K., Iida, T., Ishiura, M., & Onai, K. (2021). Rhythmic adenosine triphosphate release from the cyanobacterial circadian clock protein KaiC revealed by real‐time monitoring of bioluminescence using firefly luciferase. Genes to Cells, 26(2), 83-93.
Reviews
  1. Sugihara, Y., Kudoh, A., Oli, M. T., Takagi, H., Natsume, S., Shimizu, M., Abe, A., Asiedu, R., Asfaw, A., Adebola, R. & Terauchi, R. (2021). Population Genomics of Yams: Evolution and Domestication of Dioscorea Species. In: Population Genomics. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/13836_2021_94
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 直立するオスと下垂するメス:雌雄異株植物オニドコロの花序角度に種子食者が及ぼす影響 (ポスター). 第53回種生物学シンポジウム, オンライン, 2021年12月
  2. 細井早菜子*, 富田淳, 村川未果, 前田麻友子, 山根京子, 太田敦士. コムギ近縁野生種Aegilops longissimaAe. sharonensis における側芒抑制候補遺伝子C2H2-ZFの塩基配列多型および発現解析 (ポスター). 第28回育種学会中部地区談話会, オンライン, 2021年11月 ※優秀ポスター優秀賞
  3. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 直立するオスと下垂するメス ―雌雄異株植物オニドコロにおける花形質と訪花数の雌雄差 (ポスター). 第68回日本生態学会大会, オンライン, 2021年3月 ポスター優秀賞
  4. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. ヤマノイモ属オニドコロに誘引される送粉昆虫相 (口頭発表). 日本植物分類学会第20回大会, オンライン, 2021年3月
  5. 太田敦士*. データ解析実習支援 – ヒャクニンノッテモダイジョウブなデータ解析環境を求めて – (ポスター口演発表). 第32回生物学技術研究会, オンライン, 2021年2月
2020
Research Articles
  1. Yu Sugihara, Kwabena Darkwa, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Motoki Shimizu, Akira Abe, Akiko Hirabuchi, Kazue Ito, Kaori Oikawa, Muluneh Tamiru-Oli, Atsushi Ohta, Ryo Matsumoto, Agre Paterne, David De Koeyer, Babil Pachakkil, Shinsuke Yamanaka, Satoru Muranaka, Hiroko Takagi, Ben White, Robert Asiedu, Hideki Innan, Asrat Asfaw, Patrick Adebola, Ryohei Terauchi (2020). Genome Analyses Reveal the Hybrid Origin of the Staple Crop White Guinea Yam (Dioscorea rotundata). PNAS, 117 (50) 31987-31992; DOI: 10.1073/pnas.2015830117.
  2. Oikawa, K., Fujisaki, K., Shimizu, M., Takeda, T., Saitoh, H., Hirabuchi, A., … Terauchi, R. (2020). The blast pathogen effector AVR-Pik binds and stabilizes rice heavy metal-associated (HMA) proteins to co-opt their function in immunity. BioRxiv, 2020.12.01.406389. https://doi.org/10.1101/2020.12.01.406389
  3. Kato, H., Onai, K., Abe, A., Shimizu, M., Takagi, H., Tateda, C., Utsushi, H., Singkarabanit-Ogawa, S., Kitakura, S., Ono, E., Zipfel, C., Takano, Y., Ishiura, M., Terauchi, R. (2020). Lumi-Map, a real-time luciferase bioluminescence screen of mutants combined with MutMap, reveals Arabidopsis genes involved in PAMP-triggered immunity. Molecular Plant-Microbe Interactions, https://doi.org/10.1094/MPMI-05-20-0118-TA.
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 筒泉宏樹*, 太田敦士, 杉原優, 寺内良平. コムギ近縁野生種Aegilops caudata の系統解析 (ポスター). 第15回ムギ類研究会, オンライン, 2020年12月
  2. 西原萌笑*, 太田敦士, 寺内良平. Aegilops bicornis 種内における芒の⻑さの違いに関わる遺伝子座の特定 (ポスター). 第15回ムギ類研究会, オンライン, 2020年12月 ※ポスター優秀賞
  3. 西原萌笑, 杉原優, 寺内良平, 太田敦士*. Aegilops bicornis 遺伝資源系統にみられる東西地域間の遺伝的分化 (ポスター). 第15回ムギ類研究会, オンライン, 2020年12月
  4. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 雌雄異株植物オニドコロにおける昆虫誘因の雌雄差 (ポスター). 第52回種生物学シンポジウム, オンライン, 2020年12月
  5. 工藤葵*, 杉原優, 太田敦士, 寺内良平. 雌雄異株植物オニドコロにおける訪花昆虫の特定と訪花数の雌雄差 (口頭発表). 第9回近畿植物学会講演会, オンライン, 2020月11年
2019
Research Articles
  1. Shimizu, M., Nakano, Y., Hirabuchi, A., Yoshino, K., Kobayashi, M., Yamamoto, K., Terauchi, R., & Saitoh, H. (2019). RNA‐Seq of in planta‐expressed Magnaporthe oryzae genes identifies MoSVP as a highly expressed gene required for pathogenicity at the initial stage of infection. Molecular plant pathology, 20(12), 1682-1695.
  2. Seto, Y., Yasui, R., Kameoka, H., Tamiru, M., Cao, M., Terauchi, R., … & Yamaguchi, S. (2019). Strigolactone perception and deactivation by a hydrolase receptor DWARF14. Nature communications, 10(1), 1-10.
  3. Tanaka, N., Yoshida, S., Takagi, H., Terauchi, R., Shimizu, A., & Fujiwara, T. (2019). Evidence for rice heading date 16 contribution to yield increase under low-nutrient conditions. Soil Science and Plant Nutrition, 65(6), 589-597.
  4. Itoh, N., Segawa, T., Tamiru, M., Abe, A., Sakamoto, S., Uemura, A., … Terauchi, R. & Takagi, H. (2019). Next-generation sequencing-based bulked segregant analysis for QTL mapping in the heterozygous species Brassica rapa. Theoretical and Applied Genetics, 132(10), 2913-2925.
  5. Takagi, M., Hamano, K., Takagi, H., Morimoto, T., Akimitsu, K., Terauchi, R., … & Ichimura, K. (2019). Disruption of the MAMP-induced MEKK1-MKK1/MKK2-MPK4 pathway activates the TNL immune receptor SMN1/RPS6. Plant and Cell Physiology, 60(4), 778-787.
  6. Valent, B., Farman, M., Tosa, Y., Begerow, D., Fournier, E., Gladieux, P., … Terauchi, R., Tharreau, D., & Zhang, N. (2019). Pyricularia graminis‐tritici is not the correct species name for the wheat blast fungus: response to Ceresini et al.(MPP 20: 2). Molecular plant pathology, 20(2), 173.
  7. Irieda, H., Inoue, Y., Mori, M., Yamada, K., Oshikawa, Y., Saitoh, H., Uemura, A., Terauchi, R., … & Takano, Y. (2019). Conserved fungal effector suppresses PAMP-triggered immunity by targeting plant immune kinases. Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(2), 496-505.
2018
Research Articles
  1. De la Concepcion, J. C., Franceschetti, M., Maqbool, A., Saitoh, H., Terauchi, R., Kamoun, S., & Banfield, M. J. (2018). Polymorphic residues in rice NLRs expand binding and response to effectors of the blast pathogen. Nature plants, 4(8), 576.
Reviews
  1. Białas, A., Zess, E. K., De la Concepcion, J. C., Franceschetti, M., Pennington, H. G., Yoshida, K., …, Terauchi, R., Banfield, M., & Kamoun, S. (2018). Lessons in effector and NLR biology of plant-microbe systems. Molecular Plant-Microbe Interactions, 31(1), 34-45.
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 富田淳*, 山根京子, 太田敦士. コムギ近縁野生種Aegilops longissimaAe. sharonensis における穂の形態的二型のQTLマッピング (ポスター発表). 第26回育種学会中部地区談話会, 2018年10月
  2. 富田淳*, 山根京子, 太田敦士. コムギ近縁のエギロプス属シトプシス節でみられる穂の形態的二型の遺伝解析 (口頭発表). 日本育種学会第134回講演会, 岡山大学, 2018年9月
2017
Research Articles
  1. Kobayashi, M., Hiraka Y., Abe, A., Yaegashi, H., Natsume, S., Kikuchi, H., Takagi, H., Saitoh, H., Win, J., Kamoun, S., Terauchi, R. (2017) Genome analysis of the foxtail millet pathogen Sclerospora graminicola reveals the complex effector repertoire of graminicolous downy mildews. BMC Genomics 18:897
  2. Tamiru, M., Natsume, S., Takagi, Hiroki, White, B., Yaegashi, H., Shimizu, M., Yoshida, K., Uemura, A., Oikawa, K., Abe, A., Urasaki, N., Matsumura, H., Babil, P., Yamanaka, S., Matsumoto, R., Muranaka, S., Girma, G., Lopez-Montes, A., Gedil, M., Bhattacharjee, R., Abberton, M., Kumar, L., Rabbi, I., Tsujimura, M., Terachi, T., Haerty, W., Corpas, M., Kamoun, S., Kahl, G., Takagi, Hiroko, Asiedu, R., Terauchi, R. (2017). Genome sequencing of the staple food crop white Guinea yam enables the development of a molecular marker for sex determination. BMC biology, 15(1), 86.
  3. Inoue, Y., Vy, T. T., Yoshida, K., Asano, H., Mitsuoka, C., Asuke, S., Anh, V., Cumagun, C., Chuma, I., Terauchi, R., Kato, K., Mitchell, T., Valent, B., Farman, M., Tosa, Y. (2017). Evolution of the wheat blast fungus through functional losses in a host specificity determinant. Science, 357(6346), 80-83.
  4. Wu, C. H., Abd-El-Haliem, A., Bozkurt, T. O., Belhaj, K., Terauchi, R., Vossen, J. H., & Kamoun, S. (2017). NLR network mediates immunity to diverse plant pathogens. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), 114(30), 8113-8118.
Reviews
  1. Bialas, A., Zess, E., De la Concepcion JC., Franceschetti, M., Pennington, HG., Yoshida, K., Uson, JL., Chanced, E., Wu, C.-H., Languor, T., Maqbool, A., Varden, FA., Derevnina, L., Belhaj, K., Fujisaki, K., Saitoh, H., Terauchi, R., Banfield, M., Kamoun, S. (2017) Lessons in Effector and NLR Biology of Plant-Microbe Systems. Molecular Plant-Microbe Interactions DOI10.1094/MPMI-08-17-0196-FI.
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 新田みゆき*, 太田敦士. これで完璧! コムギ・エギロプス栽培のいろはに (口頭発表). 第12回ムギ類研究会, 京都大学, 2017年12月
2016
Research Articles
  1. Yasui, Y., Hirakawa, H., Oikawa, T., Toyoshima, M., Matsuzaki, C., Ueno, M., Mizuno, N., Nagatoshi, Y., Imamura, T., Miyago, M., Tanaka, K., Mise, K., Tanaka, T., Mizukoshi, H., Mori, M., Fujita, Y. (2016) Draft genome sequence of an inbred line of Chenopodium quinoa, an allotetraploid crop with great environmental adaptability and outstanding nutritional properties. DNA Research, 23(6): 535-546.
  2. Ohta A., Yamane K., Kawahara T. (2017) Relationship between spike morphology and habitat of four Aegilops species of section Sitopsis. Genetic Resources and Crop Evolution, 64(5): 889-899. [First Online: 28 April 2016].
  3. Yasui, Y., Hirakawa, H., Ueno, M., Matsui, K., Katsube-Tanaka, T., Yang, S. J., Aii, J., Sato, S., Mori, M. (2016) Assembly of the draft genome of buckwheat and its applications in identifying agronomically useful genes. DNA Research, 23(3): 215-224.
Presentations in Japan

* Presenter

  1. 村川未果*, 太田敦士, 前田麻友子, 富田淳, 河原太八, 山根京子. コムギ近縁野生種Aegilops longissimaAe. sharonensis における穂の形態形質に関する適応度調査と連鎖解析. 第24回育種学会中部地区談話会, 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構野菜花き研究部門, 2016年11月